La Facultad de Medicina de la Universidad Autónoma del Estado de México (UAEMéx) cuenta con 30 especialidades médicas hospitalarias, caracterizadas por su calidad y excelencia académica, lo que ha permitido que se impartan en 57 sedes hospitalarias a nivel estatal y en entidades vecinas como la Ciudad de México y Michoacán.

En territorio estatal, el estudiantado de las especialidades médicas de la UAEMéx participa en ocho instituciones: el Instituto de Salud del Estado de México (ISEM), Instituto Materno Infantil del Estado de México (IMIEM), Instituto de Seguridad Social del Estado de México y Municipios (ISSEMyM); Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS Poniente y Oriente); Hospital de Alta Especialidad en Zumpango; Instituto de Seguridad y Servicios Sociales de Los Trabajadores del Estado (ISSSTE) y el Centro de Rehabilitación y Educación Especial (CREE DIF).

Por primera vez, la Autónoma mexiquense cuenta con un programa de estudios fuera del Estado de México, en el Hospital General “Dr. Miguel Silva” de la Secretaría de Salud de Michoacán y del Órgano Público Descentralizado de los Servicios de Salud de Michoacán en donde se imparte la especialidad de Cirugía Maxilofacial.

Mientras que en el Hospital Pediátrico "La Villa", en el Hospital Enrique Cabrera Cossio, en el Hospital de Especialidades "Dr. Belisario Domínguez" y en el Hospital General Ajusco Medio "Dra. Obdulia Rodríguez", pertenecientes a la Secretaría de Salud de la Ciudad de México (SEDESA) se imparten las especialidades de Pediatría, Neonatología, Anestesiología, Cirugía General y Ginecología y Obstetricia, las cuales tienen una alta demanda por parte del estudiantado.

Cabe hacer mención que en los últimos diez años más de cuatro mil personas han egresado de los planes de estudio de especialidades médicas y quirúrgicas de la UAEMéx, asimismo, 70 estudiantes extranjeros se encuentran cursando estudios en un programade especialidad de la UAEMéx.